《天津中医药》
1 方法
1.1 药物–性–味–归经网络的构建
1.2 有关成分的收集、筛选和作用靶点的预测
1.3 疾病靶点的获取
1.4 可视化网络的构建和分析
1.5 蛋白互作(PPI)网络构建和核心靶点的筛选
1.6 交集靶点的基因本体(GO)功能富集和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析
2 结果
2.1 宣肺败毒方的药物–性–味–归经网络
2.2 活性成分及其靶点
2.3 疾病靶点和成分–疾病交集靶点的获取
2.4 可视化网络的构建和分析
2.5 PPI网络和核心靶点的获取
2.6 交集靶点的GO功能富集分析和KEGG通路富集分析
3 讨论
4 结论
文章摘要:目的探讨宣肺败毒方对冠状病毒感染治疗作用的有效成分、作用靶点、信号通路等,从而阐释其作用机制。方法利用Cytoscape构建了宣肺败毒方的药物–性–味–归经网络。采用TCMSP数据库、SwissADME数据库和Swiss Target Prediction数据库筛选宣肺败毒方的有效成分和相关靶点,通过GeneCards数据库和CTD数据库收集严重急性呼吸道疾病(SARS)、2012年的中东呼吸综合征(MERS)和新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的疾病靶点,将药物靶点和疾病靶点取交集,利用Cytoscape软件构建网络;运用String数据库,对潜在靶点进行蛋白相互作用(PPI)网络模型构建;通过Metascape数据库对潜在靶点进行GO和KEGG富集分析,并且用Cytoscape构建网络。结果宣肺败毒方中有10种药材与肺经有关。从中筛选出167个活性成分和242个潜在作用靶点,核心药物为甘草、麻黄、青蒿、马鞭草、虎杖,核心成分为槲皮素、豆甾醇、山柰酚、木犀草素、异鼠李素等,核心靶点为AKT1、IL-6、TP53、VEGFA、TNF等,可能的作用机制与PI3K-Akt signaling pathway、HIF-1 signaling pathway和TNF signaling pathway等多个信号通路有关。结论通过网络药理学探讨了宣肺败毒方对SARS、MERS和COVID-19的潜在共同作用机制,体现了中药多成分、多靶点、多途径的作用特点。
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